南京卫生分院全日制在校学生8700余人，成人教育学生6000余人，各级各类学生共万余人，设有卫生管理与基础学院、护理学院、临床医学院、药学院、中西医结合学院（康复学院）、继续教育学院6个二级学院，开设临床医学、中医学、预防医学、针灸推拿、护理、助产、药学、中药、康复治疗技术、中医康复、卫生信息管理、医学影像技术、医学检验技术等19个专业。

          南京卫生分院建有校内情景化实训室57个，教学科研仪器设备7749台，总值达10477.47万元，生均15724.86元。校企合作企业202家，开办南京市高淳人民医院、太仓市第一人民医院、江宁医院等驻点班10个。主办《中国肿瘤外科杂志》、《医药高职教育与现代护理》两本期刊，其中《中国肿瘤外科杂志》被2018年、2019年中国科技核心期刊目录收录。学校获公开授权专利31项，《言语治疗技术》为省级在线开放课程。“江苏卫生健康国家职业技能鉴定所”为国家级职业技能鉴定机构，承担养老护理员、育婴员、美容师等职业技能鉴定工作。